我校教师昝乡镇主持申报的项目《基于吸引域变化的基因调控网络的干预研究》获浙江省自然科学基金一般项目立项。

基因组学研究的一个主要的目的就是如何有效地的干预系统，使得系统朝人们期望的方向演化。本研究直接从吸引域结构的改变入手，研究基因调控网络结构干预的方法和理论。我们主要开展了以下几方面的研究：（1）我们在重叠基因降权（PADOG）方法基础上提出了一种基于基因重要性和特异性的通路分析方法PAGIS。实验结果表明，PAGIS方法比PADOG能够提高很多癌症相关的排名，从而提高癌症相关通路的识别效果。此外，我们将基因的重要性和特异性考虑到SPIA方法中并提出SPIA_IS方法。数据结果表明：我们提出的方法可以识别更多的癌症相关通路；（2）2016年我们提出的基于状态域的最优干预算法可以明显改进算法的时间复杂度，但是该算法的加过程和减过程非常复杂。 我们提出了净状态域（netBOSs）的概念。根据受干扰状态的先后顺序，可以很简单的计算出其netBOSs，该方法不仅提高了时间效率，也简化了计算过程。（3）我们提出了一种名为miR_SubPath的新方法，通过三个步骤来鉴定疾病相关的miRNA。数据结果显示，所提出的miR_SubPath方法比先前的方法更强健并且可以鉴定更多的疾病相关的miRNA。（4）基于基因调控网络的研究成果，我们将其应用到综合航电系统安全性分析领域，提出的一种有效的算法可以快速预测系统安全是否发生故障，以及发生故障的条件下如何通过有效的干预，使得系统尽快恢复到期望的安全状态。